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La bioinformatique et les séquences

le 19 septembre 2017

15h30 - 17h30

ENS Rennes, Salle du conseil
Plan d'accès

Intervention de Pierre Peterlongo, chercheur Inria dans l'équipe GenScale, 
dans le cadre des séminaires du département Informatique et télécommunications.

Séminaire Informatique et télécommunications

Séminaire Informatique et télécommunications

Dans cet exposé je présenterai une vue globale de la bioinformatique : quelle est son origine, son utilité, dans quels domaines elle est appliquée et quels sont les grands domaines de l'informatique qu'elle utilise. 

Dans un second temps, je présenterai plus en détails quelques réalisations de l'équipe GenScale <https://team.inria.fr/genscale/>. Cette équipe est spécialisée dans la création de méthodes algorithmiques permettant l'analyse de très grosses masses de données, généralement issues des séquenceur de génomes. 

Ainsi je présenterai plus précisément la problématique de l'assemblage et une structure de données permettant de stocker et d'indexer les "mots" qui sont utilisés pour effectuer cet assemblage. Je présenterai également une méthode qui a été utilisée dans le cadre du projet Tara Ocean pour comparer d'énormes masses de données permettant de suivre l'évolution du plancton océanique <https://www.embl.de/tara-oceans/start/>.


Thématique(s)
Formation, Recherche - Valorisation
Contact
David Cachera & Luc Bougé

Mise à jour le 18 septembre 2017